柯琴在编注此书时，贯串了“仲景之六经为百病立法，不专为伤寒一科”的思想，对《伤寒论》原文逐条逐句地加以研究、校正。前列伤寒总论，次述六经病证。编排上以“以证名篇”为特点，如麻黄、桂枝、白虎、承气、柴胡汤证等，各以相关条目归纳类聚。