全书分4章。第一章清太医院瘟疫辩论原文，第二章删补论，第三章方治，第四章后论。其论疫病发生机理，谓受病多自口鼻而入，由气管达于血管，将气血凝结壅于淋巴管上口、总汇管之津门，津郁成痰，阻痹气机，内陷心包，瘀塞血络，静脉郁血而发急痧，意在中西互参而论之。后附治疫验方，其中开窍急救丹、朱雄化毒丸、防疫救急丹为急救用方；通变升降清化汤，通变增损三黄石膏汤为治疫常用方。