全书4种。收有《伤寒论浅说》介绍脏腑经络各病证；《金匮经浅说》邱氏将各类杂病以脏腑、经络、表里、阴阳、寒热、虚实的不同情况重予编列《金匮要略》原文，分为上、中、下三化。上化为肺心膈及皮肤传化之主，中化为肝胆脾胃三焦及肌肉变化之所书，下化为膀胱肾及骨髓生化之原。持论存阴阳废五行，对原文详予注释。《邱氏温病学》先论温病苔脉、病状及传经变化特征，后述温病与瘟疫、伤寒、感冒之区别，再辨四时温病之异及温病辩证个、治法、方药，《邱氏脉学》详细阐述平脉法、脉象类别、诊脉法、六脉部位、八纲脉表、妇人脉、少儿脉。