上卷以论脏腑为主，书中所绘“改正脏腑图”及对脏腑的论述，纠正了前人关于脏腑认识方面的一些错误。书中对“脑主思维”的认识，纠正了传统的“心主思维”的错误观点，对后世医家影响颇大。下卷以论半身不遂证治为主，在病因、病机和治疗方药方面作了探讨，并载自制方剂28个。