卷首为医学源流知识、服药论，又以伤寒六经为主线，绘有六经图及血液循环图；卷二列六经证治，以分经论述为主；卷三至卷五以六经循环部位为基础，分述头、目、耳、面、咽喉、胸背、前后阴、手足等病症辩治；卷六阐述五脏六腑，并参入见解；卷七论述痰饮等证；卷八至卷十二为杂病类；卷十三为温疫证治等；卷十四乃妇人疾病论；卷十五列小儿疾病证治论；卷十六设痘证问答，辨析痘证发热、牛痘流考等。