全书分为4部分：胎生的考察、胎生的时代、汉方医学理论的基础、汉方医学学说的构成和发达。书末附有日本年代索引、本草书类（日本著作）、中国历代概表、中国本部地名古今对照。本书将宋代朱熹理学和太极图说作为汉方医学学说构成的重要基础，并将历代著名医家分为三派：张机、皇甫谧、范汪、孙思邈、孟宪、陈藏器、刘完素、张元素、滑寿、朱丹溪等列为儒医；扁鹊、医和等列为明医；钱乙等列为德医。并论述日本古方派的形成，以及三才思想、五行思想、营气卫气、仙禅道术等。