本书按科目分为本草类、内经类、脉诀类、金匮伤寒类、证治内症杂病类、医案类方剂类、眼科类、喉科类、女科类、儿科、痘疹类、外科针灸类、杂书类和丛书类。分类汇编书目，便于查阅。对木刻版本和石印本区别记载，为版本学研究提供了资料。