卷上为一至二十九难，卷下为三十至八十一难。卷首总论，汇集有关序跋及提要等八篇，另附廖氏所撰“难经悬解提要驳义”、“俞曲国脉鉴篇驳义”、“难经旧名考”3篇。本书是在徐灵胎《难经经释》的基础上撰成，补徐氏之未发，正徐注之误，故名“补正”。全书择选徐氏注解，并补充吕广、丁德用、滑寿、丹波元胤诸家见解，而徐氏按语则全文照录，间附廖氏按语，评议各家得失。